Una delle aree di maggior sviluppo in Intelligenza Artificiale è lo studio e la progettazione di Sistemi Esperti detti anche Expert Systems o Knowledge-Based Systems. La loro caratteristica fondamentale è la capacità di eseguire compiti,   normalmente di competenza della flessibilità e capacità di un cervello umano con conoscenze ed esperienza nel settore. Il Sistema Esperto deve essere capace di emulare l'operato di un esperto registrando i processi mentali e di logica che normalmente questi applica al proprio settore di competenza, in particolare il sistema deve essere in grado di compiere le stesse azioni, dare gli stessi giudizi, esibire le stesse spiegazioni. Un Sistema Esperto si fonda sulla competenza umana registrata nella cosiddetta base di conoscenza (ad esempio sotto forma di regole), aggiornabile in base all'esperienza. Come avviene per l'esperto umano, il Sistema Esperto può operare su dati qualitativi e incompleti. Può utilizzare forme di ragionamento approssimato,		attraverso tecniche probabilistiche o facendo ricorso alla cosiddetta "fuzzy logic", tradotta spesso come "logica sfumata", un tipo di logica non basata sui principi della   logica formale di vero e falso (principio del "tertium non datur") ma a più valori. Una delle principali attività di MC3 Informatica è la ricerca e lo sviluppo di nuove tecnologie applicabili ai sistemi esperti. Il team di tecnici della società ha infatti già sviluppato in passato alcuni Sistemi Esperti: uno degli ambiti di applicazione è per esempio la quadratura delle note contabili bancarie per una società di factoring   di aziende farmaceutiche. Allo stato attuale i tecnici di MC3 stanno sviluppando un sistema esperto per la lettura dei bilanci aziendali e la loro decodifica. Proprio grazie ai progetti sviluppati e   a quelli in via di completamento l'esperienza di MC3 Informatica nell'ambito dei Sistemi Esperti si può dire comprovata ed estesa.